Perubahan struktur kromosom, terjadi karena:
Delesi
Delesi adalah peristiwa hilangnya sebagian kromosom karena patah. Ada dua macam delesi yaitu delesi terminal dan delesi interkalar. Delesi terminal Jika patahnya kromosom di dekat ujung kromosom dan delesi interkal terjadi jika patahan terjadi di dua tempat, sehingga bagian tengah kromosom yang patah dapat hilang.
Duplikasi
Duplikasi adalah penambahan jumlah pada kromosom normal karena ada kromosom yang patah.
Inversi
Inversi adalah peristiwa membaliknya urutan basa nitrogen suatu gen kembali denganĀ urutan yang terbaik. Ada dua macam inversi yaitu inversi parasentris dan inversi perisentri. Inversi parasentris terjadi jika kromosom patah di dua tempat tetapi dalam satu lengan. Sedangkan, inversi perisentri jika kromosom patah didua tempat tetapi pada lengan yang berbeda.
Katenasi
Katenasi terjadi karena ujung kromosom homolog saling berdekatan dan akan membentuk suatu lingkaran.
Translokasi
Translokasi yaitu pindahnya potongan kromosom ke potongan kromosom lain yang bukan homolognya.