Perbedaan antara Alga Merah dan Alga Hijau adalah:

Alga Merah	Alga Hijau
Sebagian besar hidup di air laut	Sebagian besar hidup di air segar dan subaerial
Spesies uniselulernya sedikit.	Spesies uniselulernya berlimpah
Tilakoid yang tidak ditumpuk	Tilakoid ditumpuk dalam kelompok 2-20
Klorofil jenis a dan d	Klorofil tipe a dan b
Fukoskantin mungkin ada	Fukoskantin tidak ada
Fikobilinsnya ada	Fikobilinsnya tidak ada
Cadangan makanan pati floridean.	Cadangan makanan pati
Tahap motilnya tidak ada	ada flagela apikal dan equal
Dinding sel mengandung selulosa dan fikokolloid sulfat.	Dinding sel adalah selulosa

 

Alga termasuk di bawah Kerajaan planate oleh Whittaker (1969) adalah ganggang merah, ganggang coklat dan ganggang hijau. Alga biasanya dibedakan atas dasar pigmen dan produk penyimpanan. Alga didefinisikan sebagai klorofilluss, thalloid, tanaman vaskular tanpa diferensiasi selular. Alga biasanya hidup air, baik laut atau air tawar. Hanya beberapa ganggang terjadi pada habitat darat lembab seperti batang pohon, batu basah, tanah lembab dll

Alga hijau: Tanaman air tawar atau laut. Mungkin berbagai bentuk seperti motil uniseluler (Chalmydomonas), non motil (Chlorella), clonial (Volvox, Hydrodictyon), parenkim (Ulva), coenocytic (Volvox).

Alga merah: Ini adalah yang paling mencolok dari rumput laut dan sebagian besar adalah laut. Warna ini disebabkan adanya pigmen merah (r-phycoerythrin) dan pigmen biru (r-phycocyanin) di kromatoforanya. Contoh: Polysiphonia, Gelidium, Rhodymenia, Batrachospermum.