Pada eukariotik, molekul mRNA yang monosistronik berisi urutan pengkodean hanya untuk satu polipeptida. Di prokariota, molekul mRNA bakteri individu memiliki transkrip polisistronik dari beberapa gen dari jalur metabolisme tertentu.

Perbedaan antara mRNA polisistronik dan monosistronik  adalah sebagai berikut:

mRNA Polisistronik	mRNA Monosistronik
Berisi kodon dari lebih dari satu cistron	Berisi kodon dari cistron tunggal
Kode hanya untuk lebih dari satu protein	Kode hanya untuk protein tunggal
Ditranskripsi dari lebih dari satu gen (cistron) dan memiliki banyak inisiasi dan terminasi kodon	Ditranskripsi dari gen tunggal (cistron) dan memiliki satu inisiasi dan terminasi kodon
Ditemukan di prokariotik	Ditemukan di eukariotik