Computer-Aided Drug Design (CADD) CADD membantu para ilmuwan dalam meminimalkan upaya pengujian sintetis dan biologis dengan hanya berfokus pada senyawa yang paling menjanjikan. Selain menjelaskan dasar molekuler aktivitas terapeutik, juga memprediksi kemungkinan turunan yang akan meningkatkan aktivitas.
Bagaimana dan di mana komputer digunakan untuk penemuan obat?
Saat ini teknologi Computer Aided Drug Design (CADD) digunakan dalam nanoteknologi, biologi molekuler, biokimia, dll. Desain obat berbantuan komputer dapat diterapkan pada penyakit kanker, transportasi obat ke tempat tertentu dalam tubuh, pengumpulan dan penyimpanan data organik dan biologis.
Teknik apa yang digunakan dalam merancang obat?
SBDD mencakup pendekatan seperti docking molekuler, skrining virtual (VS), pemodelan farmakofor berbasis struktur, dan desain obat de novo, sedangkan pendekatan LBDD mencakup skrining berbasis kesamaan, pemodelan hubungan struktur-aktivitas kuantitatif (QSAR), pemodelan farmakofor berbasis ligan , dan scaffold hopping.
Apa itu skrining virtual dalam penemuan obat?
Skrining virtual (VS) adalah teknik komputasi yang digunakan dalam penemuan obat untuk mencari perpustakaan molekul kecil untuk mengidentifikasi struktur yang paling mungkin untuk mengikat target obat, biasanya reseptor protein atau enzim.
Bagaimana cara membuat molekul obat?
Ada tiga metode utama untuk penentuan struktur yang berguna untuk desain obat: kristalografi sinar-X, NMR, dan pemodelan homologi. Evaluasi struktur dari masing-masing metode akan dibahas.
Bagaimana alat pemodelan protein 3D membantu dalam pengembangan obat atau vaksin?
Dibandingkan dengan sistem kultur sel 2D tradisional, kultur sel tiga dimensi (3D) dapat berfungsi sebagai sistem model yang lebih baik untuk pengembangan vaksin dengan menyediakan lingkungan mikro yang mereplikasi pengaturan fisiologis sel nyata, memungkinkan identifikasi toksisitas dan masalah lain yang tidak diinginkan dengan lebih awal. pada 22 Maret 2021.
Bagaimana komputer terkena virus?
Beberapa virus komputer diprogram untuk merusak komputer Anda dengan merusak program, menghapus file, atau memformat ulang hard drive. Yang lain hanya mereplikasi diri mereka sendiri atau membanjiri jaringan dengan lalu lintas, sehingga tidak mungkin untuk melakukan aktivitas internet apa pun.
Manakah dari pendekatan berikut ini yang dipertimbangkan dalam perancangan obat berbasis ligan?
Dasar-dasar QSAR Pendekatan yang paling populer untuk desain obat berbasis ligan adalah metode QSAR dan pemodelan farmakofor. QSAR adalah metode komputasi untuk mengukur korelasi antara struktur kimia dari serangkaian senyawa dan proses kimia atau biologis tertentu.
Apa perbedaan antara desain obat berbasis ligan dan berbasis struktur?
Ketika ada ligan alami yang ada dalam protein, fitur protein itu atau fitur ligan yang sudah diusulkan digunakan untuk merancang ligan baru yang memiliki afinitas lebih dari yang ada dikatakan berbasis Ligan saat mengusulkan ligan baru/molekul kecil atas dasar mengikat saku atau hot spot.
Apa pentingnya desain obat dengan bantuan komputer?
CADD (Computer Aided Drug Design) adalah teknik yang menggunakan perangkat lunak untuk memprediksi nilai struktur sifat-sifat spesies molekul yang diketahui, tidak diketahui, stabil dan tidak stabil menggunakan persamaan matematika [1,2]. Komputer adalah alat penting dalam kimia modern dan penting dalam penemuan dan pengembangan obat.
Apa tujuan utama dari pendekatan penemuan obat berbasis fragmen?
Penemuan obat berbasis fragmen (FBDD) adalah pendekatan baru, yang semakin banyak digunakan dalam industri farmasi, untuk mengurangi gesekan dan menyediakan petunjuk untuk target biologis yang sebelumnya sulit dikendalikan. FBDD mengidentifikasi ligan dengan berat molekul rendah ( 150 Da) yang mengikat makromolekul penting secara biologis.
Apa yang dimaksud dengan desain obat de novo?
Desain obat de novo adalah proses berulang di mana struktur tiga dimensi reseptor digunakan untuk merancang molekul yang lebih baru. Ini melibatkan penentuan struktur kompleks target timbal dan desain modifikasi timbal menggunakan alat pemodelan molekul.
Apakah yang Anda maksud: desain obat
Desain obat adalah proses inventif untuk menemukan obat baru berdasarkan pengetahuan tentang target biologis. Dalam pengertian yang paling dasar, desain obat melibatkan desain molekul yang saling melengkapi dalam bentuk dan muatan ke target molekul yang dengannya mereka berinteraksi dan mengikat.
Bagaimana komputer membantu para ilmuwan untuk merancang obat target tertentu?
Untuk membuat obat yang akan berinteraksi dengan target protein dengan cara yang diinginkan, ahli kimia biasanya memulai dengan model struktural terkomputerisasi dari protein yang terikat pada molekul alami yang “membuka” tindakan biologis. Kemudian, mereka mencoba merancang molekul kecil yang berperilaku seperti molekul alami.
Apa itu Pemodelan komputer dalam penemuan obat?
Model komputasi dikembangkan menggunakan himpunan bagian dari data yang disimpan. Model divalidasi terhadap hasil dari percobaan genetik, biokimia, atau biologi molekuler. Setelah validasi, model digunakan untuk memprediksi dan menginterpretasikan biologi baru. Hipotesis yang dihasilkan diuji menggunakan teknik biologi tradisional.
Apakah Pemodelan komputer meningkatkan desain obat?
Para ilmuwan telah mengembangkan alat data berbantuan komputer yang dapat meningkatkan pengobatan untuk berbagai penyakit. Alat pemodelan komputer akan memprediksi situs baru pengikatan obat potensial yang lebih selektif, yang mengarah ke penargetan obat yang lebih efektif, meningkatkan kemanjuran terapeutik dan mengurangi efek samping.
Apa itu desain obat berbasis ligan QSAR?
Analisis hubungan struktur-aktivitas kuantitatif (QSAR) adalah metode desain obat berbasis ligan yang dikembangkan lebih dari 50 tahun yang lalu oleh Hansch dan Fujita (1964). Awalnya, pemodelan QSAR terbatas pada rangkaian kecil senyawa kongenerik dan metode regresi sederhana.
Bagaimana komputer digunakan dalam perancangan obat?
Desain obat berbantuan komputer menggunakan pendekatan komputasi untuk menemukan, mengembangkan, dan menganalisis obat dan molekul aktif biologis serupa. Pendekatan penemuan obat berbantuan komputer (LB-CADD) berbasis ligan melibatkan analisis ligan yang diketahui berinteraksi dengan target yang diinginkan.
Jenis sistem dan strategi apa yang tersedia dalam desain obat berbasis komputer?
Desain obat berbasis struktur (SBDD) dan desain obat berbasis ligan (LBDD) adalah dua jenis umum pendekatan desain obat berbantuan komputer (CADD) yang ada.
Dapatkah Pemodelan komputer digunakan untuk mengidentifikasi senyawa obat yang berguna?
Pemodelan komputasional telah diterapkan untuk memahami interaksi target obat dalam beberapa target obat antikanker yang divalidasi, untuk identifikasi inhibitor baru dari database molekul kecil dan/atau untuk penjelasan mode aksi.
Apa keuntungan dari perancangan obat komputasional dibandingkan dengan perancangan obat tradisional?
CADD mampu meningkatkan tingkat hit senyawa obat baru karena menggunakan pencarian yang jauh lebih bertarget daripada HTS tradisional dan kimia kombinatorial. Ini tidak hanya bertujuan untuk menjelaskan dasar molekuler dari aktivitas terapeutik tetapi juga untuk memprediksi kemungkinan turunan yang akan meningkatkan aktivitas.
Apa itu desain obat dalam bioinformatika?
Desain obat, sering disebut sebagai desain obat rasional atau hanya desain rasional, adalah proses inventif untuk menemukan obat baru berdasarkan pengetahuan tentang target biologis.
Manakah dari program perangkat lunak berikut yang digunakan untuk desain obat de novo otomatis?
LUDI adalah program perangkat lunak yang digunakan dalam desain obat de novo. DOCK digunakan untuk mengikat molekul ke tempat pengikatan.
Apa yang dimaksud dengan desain obat rasional?
Desain obat rasional mengacu pada desain molekul obat yang mengikat target (misalnya protein, asam nukleat). Itu bergantung pada pengetahuan sebelumnya tentang struktur, fungsi, dan mekanisme target, sehingga menghindari pengujian acak ribuan molekul.
